Последней надеждой в поиске пропавшей без вести сотрудницы ФБР становятся бывшие специальные агенты Фокс Малдер и Дана Скалли - вынужденно, хотя и по разным причинам, оставившие службу. Единственным человеком, дающим следствию хоть какую-то информацию, является престарелый Джозеф Криссман, в прошлом священник, отбывший наказание за совращение малолетних, который уверяет, что картины совершённых преступлений непроизвольно — «по воле Бога» — возникают в его сознании…

Даллас, штат Техас. Бомба террориста уничтожает здание. Спецагенты ФБР Фокс Малдер и Дана Скалли в ходе расследования сталкиваются с тайным заговором, превосходящим по опасности все, что они до этого встречали. Рискуя жизнью и карьерой, Малдер и Скалли делают все для уничтожения смертельного вируса, способного поразить все живое на Земле и, возможно, имеющего внеземное происхождение. В этой погоне за правдой они выходят на таинственный синдикат, состоящий из могущественных людей, которые не остановятся ни перед чем ради сохранения своих секретов. Люди синдиката преследуют агентов в техасской пещере, штабе ФБР и на секретной базе в Антарктике, хранящей самый главный секрет…